Biomolecular Sequence Analysis

বায়োমলিকুলার সিকোয়েন্স অ্যানালাইসিস হল বায়োইনফরম্যাটিক্সের একটি গুরুত্বপূর্ণ শাখা, যেখানে DNA, RNA এবং প্রোটিনের সিকোয়েন্স বিশ্লেষণ করে তাদের গঠন, কার্যকারিতা এবং বিবর্তন বোঝা হয়। আধুনিক সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির মাধ্যমে বিপুল পরিমাণ ডেটা তৈরি হচ্ছে, যা বিশ্লেষণের জন্য কম্পিউটেশনাল পদ্ধতি প্রয়োজন।

বায়োমলিকুলার সিকোয়েন্স অ্যানালাইসিসের প্রধান দিকগুলি:

সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট:
- BLAST, ClustalW, MUSCLE-এর মতো টুল ব্যবহার করে সিকোয়েন্সের মিল খুঁজে বের করা হয়।
- জিনের কার্যকারিতা ও বিবর্তনীয় সম্পর্ক বোঝাতে সাহায্য করে।
জিনোম অ্যাসেম্বলি ও অ্যানোটেশন:
- সিকোয়েন্সিংয়ের ছোট ছোট সিকোয়েন্স থেকে সম্পূর্ণ জিনোম পুনর্গঠন করা। অর্থাৎ শর্ট-রিড সিকোয়েন্সিং (Illumina, PacBio) থেকে সম্পূর্ণ জিনোম পুনর্গঠন।
- জিন, রেগুলেটরি এলিমেন্ট এবং অন্যান্য কার্যকরী অঞ্চল চিহ্নিত করা।
ফাইলোজেনেটিক অ্যানালাইসিস:
- সিকোয়েন্স ডেটা ব্যবহার করে প্রজাতির বিবর্তনীয় সম্পর্ক বিশ্লেষণ।
- MEGA, PhyML, RAxML-এর মতো টুল দিয়ে ফাইলোজেনেটিক ট্রি তৈরি করা হয়।
প্রোটিন স্ট্রাকচার প্রেডিকশন:
- অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স থেকে প্রোটিনের 3D গঠন ভবিষ্যদ্বাণী (যেমন AlphaFold, SWISS-MODEL)।
ফাংশনাল জিনোমিক্স:
- জিন এক্সপ্রেশন এবং ইন্টারঅ্যাকশন ডেটা ব্যবহার করে সিকোয়েন্সের জৈবিক ভূমিকা বোঝা।